Зв'язуючись із глутаміном та гліцином, цистеїн утворює глутатіон, потужний антиоксидант, який виконує безліч функцій по всьому організму, у тому числі й підтримання імунної системи людини. Як і метіонін він виконує детоксикаційну функцію, знижуючи шкідливий вплив важких металів та ліків на організм.